Начальник Тернопільської митниці ДФС – Антонович Оксана Валентинівна:

- сектор охорони державної таємниці, технічного та криптографічного захисту інформації;

- відділ матеріального забезпечення та розвитку інфраструктури;

- сектор по роботі з персоналом;

- відділ фінансування, бухгалтерського обліку та звітності;

- юридичний сектор;

- спеціаліст з розгляду звернень та забезпечення доступу до публічної інформації;

- відділ адміністрування митних платежів;

- митний пост "Тернопіль-центральний";

- відділ організації митного контролю 

Заступник начальника митниці – Саварин Андрій Любомирович:

- сектор ІТ;

- сектор митної статистики;

- митний пост “Чортків”;

- відділ  протидії митним правопорушенням;

- сектор чергових.